Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH16O75309 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH16O75309 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH16O75309 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH16O75309 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH16O75309 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH16O75309 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH16O75309 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH16O75309 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH16O75309 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH16O75309 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH16O75309 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH16O75309 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH16O75309 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH16O75309 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH16O75309 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH16O75309 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH16O75309 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH16O75309 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH16O75309 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH16O75309 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH16O75309 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH16O75309 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH16O75309 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH16O75309 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH16O75309 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH16O75309 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH16O75309 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH16O75309 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH16O75309 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH16O75309 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH16O75309 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH16O75309 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH16O75309 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH16O75309 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH16O75309 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH16O75309 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH16O75309 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH16O75309 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH16O75309 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH16O75309 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH16O75309 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH16O75309 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH16O75309 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH16O75309 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH16O75309 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH16O75309 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH16O75309 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH16O75309 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH16O75309 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH16O75309 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH16O75309 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH16O75309 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH16O75309 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH16O75309 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH16O75309 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH16O75309 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH16O75309 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH16O75309 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH16O75309 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH16O75309 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH16O75309 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH16O75309 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH16O75309 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH16O75309 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH16O75309 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH16O75309 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH16O75309 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH16O75309 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH16O75309 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH16O75309 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH16O75309 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH16O75309 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH16O75309 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH16O75309 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH16O75309 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH16O75309 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH16O75309 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH16O75309 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH16O75309 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH16O75309 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH16O75309 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH16O75309 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH16O75309 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH16O75309 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH16O75309 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH16O75309 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH16O75309 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH16O75309 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH16O75309 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH16O75309 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH16O75309 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH16O75309 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH16O75309 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH16O75309 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH16O75309 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH16O75309 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH16O75309 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH16O75309 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH16O75309 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms