Protein–RNA interactions for Protein: O60294

LCMT2, tRNA wybutosine-synthesizing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT2O60294 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LCMT2O60294 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms