Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRID2O43424 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRID2O43424 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRID2O43424 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRID2O43424 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID2O43424 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID2O43424 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID2O43424 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID2O43424 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID2O43424 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID2O43424 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID2O43424 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID2O43424 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID2O43424 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID2O43424 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID2O43424 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID2O43424 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID2O43424 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID2O43424 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID2O43424 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID2O43424 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID2O43424 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRID2O43424 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRID2O43424 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRID2O43424 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRID2O43424 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRID2O43424 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRID2O43424 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRID2O43424 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRID2O43424 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRID2O43424 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRID2O43424 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRID2O43424 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRID2O43424 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRID2O43424 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRID2O43424 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRID2O43424 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRID2O43424 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRID2O43424 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRID2O43424 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID2O43424 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID2O43424 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID2O43424 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID2O43424 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID2O43424 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID2O43424 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID2O43424 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID2O43424 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRID2O43424 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRID2O43424 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRID2O43424 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRID2O43424 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRID2O43424 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRID2O43424 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRID2O43424 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRID2O43424 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRID2O43424 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRID2O43424 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID2O43424 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID2O43424 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID2O43424 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID2O43424 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID2O43424 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID2O43424 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID2O43424 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID2O43424 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID2O43424 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID2O43424 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID2O43424 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID2O43424 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID2O43424 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID2O43424 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID2O43424 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID2O43424 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID2O43424 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID2O43424 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID2O43424 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID2O43424 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID2O43424 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID2O43424 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID2O43424 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID2O43424 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID2O43424 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID2O43424 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRID2O43424 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRID2O43424 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRID2O43424 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GRID2O43424 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRID2O43424 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRID2O43424 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRID2O43424 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRID2O43424 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRID2O43424 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRID2O43424 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRID2O43424 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRID2O43424 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRID2O43424 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRID2O43424 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRID2O43424 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRID2O43424 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms