Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASKO14936 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASKO14936 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASKO14936 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASKO14936 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASKO14936 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASKO14936 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASKO14936 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASKO14936 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASKO14936 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASKO14936 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASKO14936 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASKO14936 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASKO14936 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CASKO14936 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASKO14936 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASKO14936 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASKO14936 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASKO14936 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASKO14936 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASKO14936 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASKO14936 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASKO14936 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CASKO14936 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASKO14936 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASKO14936 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASKO14936 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASKO14936 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASKO14936 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASKO14936 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CASKO14936 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASKO14936 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASKO14936 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASKO14936 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CASKO14936 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASKO14936 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASKO14936 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASKO14936 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASKO14936 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASKO14936 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASKO14936 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASKO14936 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASKO14936 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASKO14936 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASKO14936 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASKO14936 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASKO14936 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASKO14936 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASKO14936 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASKO14936 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASKO14936 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CASKO14936 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASKO14936 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASKO14936 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASKO14936 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASKO14936 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASKO14936 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASKO14936 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASKO14936 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASKO14936 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASKO14936 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASKO14936 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASKO14936 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASKO14936 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CASKO14936 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASKO14936 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASKO14936 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASKO14936 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASKO14936 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASKO14936 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASKO14936 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASKO14936 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASKO14936 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CASKO14936 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASKO14936 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASKO14936 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASKO14936 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASKO14936 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASKO14936 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASKO14936 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASKO14936 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASKO14936 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CASKO14936 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASKO14936 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASKO14936 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CASKO14936 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASKO14936 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASKO14936 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASKO14936 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASKO14936 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASKO14936 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASKO14936 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASKO14936 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASKO14936 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASKO14936 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASKO14936 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASKO14936 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CASKO14936 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASKO14936 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASKO14936 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms