Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GOLGA8SH3BPF8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms