Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NACAE9PAV3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms