Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVFRD-1P60508 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVFRD-1P60508 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVFRD-1P60508 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVFRD-1P60508 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVFRD-1P60508 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVFRD-1P60508 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVFRD-1P60508 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVFRD-1P60508 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVFRD-1P60508 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVFRD-1P60508 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVFRD-1P60508 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVFRD-1P60508 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms