Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms