Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGM1P36871 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGM1P36871 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGM1P36871 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGM1P36871 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGM1P36871 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGM1P36871 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGM1P36871 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PGM1P36871 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGM1P36871 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGM1P36871 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGM1P36871 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGM1P36871 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGM1P36871 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGM1P36871 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGM1P36871 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGM1P36871 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGM1P36871 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGM1P36871 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGM1P36871 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGM1P36871 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGM1P36871 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGM1P36871 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGM1P36871 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGM1P36871 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGM1P36871 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGM1P36871 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGM1P36871 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGM1P36871 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGM1P36871 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGM1P36871 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGM1P36871 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGM1P36871 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGM1P36871 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGM1P36871 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms