Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms