Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms