Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR2

ACSBG1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSBG1Q96GR2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACSBG1Q96GR2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms