Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIP10Q15642 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms