Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HADHBP55084 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHBP55084 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHBP55084 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHBP55084 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHBP55084 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHBP55084 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHBP55084 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHBP55084 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHBP55084 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHBP55084 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHBP55084 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHBP55084 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHBP55084 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHBP55084 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHBP55084 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHBP55084 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHBP55084 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms