Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms