Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms