Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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