Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.1 ms