Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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IRF4Q15306 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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IRF4Q15306 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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IRF4Q15306 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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IRF4Q15306 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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IRF4Q15306 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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IRF4Q15306 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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