Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms