Protein–RNA interactions for Protein: P20382

PMCH, Pro-MCH, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHP20382 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMCHP20382 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMCHP20382 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMCHP20382 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PMCHP20382 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PMCHP20382 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PMCHP20382 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PMCHP20382 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PMCHP20382 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHP20382 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHP20382 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHP20382 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHP20382 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHP20382 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHP20382 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHP20382 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHP20382 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHP20382 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHP20382 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHP20382 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHP20382 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHP20382 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHP20382 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHP20382 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHP20382 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHP20382 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHP20382 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHP20382 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHP20382 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms