Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDSP20132 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDSP20132 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDSP20132 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDSP20132 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDSP20132 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDSP20132 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDSP20132 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDSP20132 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDSP20132 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDSP20132 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDSP20132 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SDSP20132 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDSP20132 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDSP20132 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDSP20132 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDSP20132 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDSP20132 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDSP20132 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDSP20132 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDSP20132 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDSP20132 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms