Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHKBQ9Y259 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms