Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms