Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms