Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF10AO00220 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms