Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
APCP25054 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
APCP25054 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
APCP25054 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
APCP25054 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
APCP25054 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
APCP25054 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
APCP25054 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
APCP25054 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
APCP25054 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
APCP25054 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.36
APCP25054 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
APCP25054 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
APCP25054 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.36
APCP25054 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
APCP25054 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
APCP25054 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
APCP25054 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
APCP25054 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APCP25054 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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APCP25054 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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APCP25054 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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APCP25054 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APCP25054 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
APCP25054 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APCP25054 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APCP25054 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
APCP25054 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APCP25054 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APCP25054 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
APCP25054 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
APCP25054 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APCP25054 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APCP25054 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APCP25054 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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