Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms