Protein–RNA interactions for Protein: E2RYF7

HCG22, Protein PBMUCL2, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG22E2RYF7 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
HCG22E2RYF7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms