Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS3Q969F9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms