Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms