Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB2P29033 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB2P29033 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJB2P29033 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJB2P29033 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJB2P29033 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJB2P29033 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJB2P29033 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJB2P29033 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms