Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL8

Putative uncharacterized protein FLJ42384, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6ZVL8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6ZVL8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6ZVL8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6ZVL8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6ZVL8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6ZVL8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6ZVL8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6ZVL8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6ZVL8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6ZVL8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6ZVL8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6ZVL8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6ZVL8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6ZVL8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6ZVL8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6ZVL8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6ZVL8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6ZVL8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms