Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms