Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDRQ13258 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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