Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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