Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHS1P30084 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms