Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms