Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 RASGRP4-207ENST00000587738 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 GNAT1-201ENST00000232461 2417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 AP003355.2-201ENST00000605923 2622 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 LLGL2-205ENST00000577200 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 FAM177A1-203ENST00000396472 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 ZSCAN2-207ENST00000448803 3813 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 LARP4B-201ENST00000316157 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 ACSL6-207ENST00000379264 6539 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 MYL9-201ENST00000279022 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 TP53-201ENST00000269305 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 TP53-226ENST00000620739 2579 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 ZMAT4-202ENST00000315769 2250 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 ECD-205ENST00000454759 2084 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 PCDHA4-204ENST00000618834 10557 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 AL136295.4-201ENST00000561419 4351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 TUFT1-202ENST00000368848 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 TP53-222ENST00000617185 2724 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 COIL-201ENST00000240316 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 OS9-202ENST00000315970 2691 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 NBPF1-204ENST00000432949 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 PHACTR3-205ENST00000395636 2372 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 SERINC4-201ENST00000299969 2318 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 MSL3-207ENST00000398527 2324 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 EVL-203ENST00000544450 3704 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 SLC12A4-209ENST00000572037 3620 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 HTR3B-201ENST00000260191 2011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 ADAMTS20-202ENST00000395541 4633 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 INTS8-217ENST00000523731 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PRAC1Q96KF2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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