Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CPNE2Q96FN4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms