Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNS3Q68CZ2 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 435.3 ms