Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms