Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGIRP43119 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms