Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms