Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms