Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VILLO15195 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VILLO15195 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VILLO15195 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VILLO15195 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VILLO15195 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms