Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms