Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3GL2Q99962 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms