Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC141Q6ZP82 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms