Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FBXO42Q6P3S6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FBXO42Q6P3S6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FBXO42Q6P3S6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FBXO42Q6P3S6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FBXO42Q6P3S6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FBXO42Q6P3S6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FBXO42Q6P3S6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FBXO42Q6P3S6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FBXO42Q6P3S6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FBXO42Q6P3S6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FBXO42Q6P3S6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FBXO42Q6P3S6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FBXO42Q6P3S6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.05■□□□□ 0
FBXO42Q6P3S6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FBXO42Q6P3S6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FBXO42Q6P3S6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FBXO42Q6P3S6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FBXO42Q6P3S6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO42Q6P3S6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms